Biostatistiques et statistiques appliquées aux sciences expérimentales

L'ensemble des documents de cours sont mis à disposition ci-dessous, au fur et à mesure de l'état d'avancement du cours. Cela comprend :

Les exemples présentés en cours, réalisés à partir de scripts de simulation sous R, sont disponibles dans la section "Compléments" (format html et source R). Il est possible de charger directement tout le code avec la commande source(), par exemple :

source("http://www.aliquote.org/cours/2006_cogmaster_A4/cours/04_anova1.R")

En cas de problème, ou pour toute demande d'information, vous pouvez me contacter à l'adresse suivante : christophe.lalanne[at]gmx.net. Je transmettrai si besoin le message aux autres intervenants (P. Bessonneau, J. Mattout).

Note : L'examen final aura lieu le 22/01/07, de 17h30 à 19h dans la salle habituelle de l'ESPCI (www.espci.fr).
Note : Le matériel pour la séance supplémentaire consacrée aux statistiques bayésiennes (séance animée par Jérémie Mattout) sont disponibles ci-dessous.
Cours Fiche pratique Compléments
02/10/06
(EHESS)
Séance 1 - Introduction
Note : Vous pouvez installer R sur votre portable (téléchargement à partir du site cran.r-project.org)
09/10/06
(ESPCI)
Séance 2 - Introduction à R Fiche TP
Exemples de solutions
Fichiers données
Liens :
Mémento
16/10/06
(ESPCI)
Séance 3 - Introduction à R (2) Fiche TP
Exemples de solutions
Liens :
R Graphics (P. Murrell)
23/10/06
(ESPCI)
Séance 4 - Comparaison de moyennes et ANOVA 1 Howell, chap. 7
Exemples de solutions
scripts du cours : html | R
scripts du TP : R
Article :
Student, 1908 - The probable error of a mean.
06/11/06
(ESPCI)
Séance 5 - ANOVA 1 (suite) Howell, chap. 11 fonction : obrien.R
13/11/06
(ESPCI)
Howell, chap. 11
Exemples de solutions
scripts du TP : R
fonction : obrien2.R
Article :
Peltier et al., 1998 - Technical Note: Application of the Box-Cox Data Transformation to Animal Science Experiments
20/11/06
(ESPCI)
Séance 7 - Comparaisons multiples scripts du cours : html | R
27/11/06
(ESPCI)
Séance 8 - Rappels et pratique de la comparaison de moyennes Howell, chap. 12
Exemples de solutions
scripts du TP : R
fonction : aov.contr.R
Articles :
Killeen, P.R., 2005 - An alternative to null-hypothesis significance tests
Pruzek, B. 2006 - A new graphic for one-way ANOVA
04/12/06
(ESPCI)
Corrigé du test de connaissances
11/12/06
(ESPCI)
Séance 10 - Corrélation et régression Howell, chap. 9
Exemples de solutions
scripts du TP : R
18/12/06
(ESPCI)
Séance 11 - ANOVA à 2 facteurs Howell, chap. 13
Exemples de solutions
scripts du TP : R
Article :
Baccini, A. 2005 - Note sur les différents types de sommes de carrés en ANOVA
08/01/07
(ESPCI)
Séance 12 - Régression multiple
15/01/07
(ESPCI)
Séance 13 - Rappels sur le Modèle Linéaire Howell, chap. 15
Exemples de solutions
scripts du TP : R
22/01/07
(ESPCI)
Corrigé de l'examen (énoncé)

Fichiers de données

Les jeux de données utilisés pour illustrer les méthodes d'analyse vues en cours sont celles de Howell (2004). Les fichiers sont accessibles à partir de cette fiche descriptive.

Références


Les deux petits articles suivants pourront servir de rappels utiles concernant les erreurs d'interprétation ou d'utilisation des statistiques à ne pas commettre :

Plus généralement, un rapide survol des deux livres suivants permettra d'éviter bien des abus de langage... :

Last updated on 2007/01/27, 06:28pm